进入游戏会看到一个很简洁的操作界面，选择“开始游戏”就可以开启飞行模式了，与一般的跑酷类游戏的玩法一样，《飞船酷跑VR》的操作也十分简单。游戏中，玩家模拟的是一架飞机，通过左右摆动戴着头显的脑袋对游戏中的飞机进行操控，躲避游戏中的各种障碍物获取道具来闯关，随着后期越来越快的速度游戏的难度也越来越高，对玩家的反应能力要求也越来越高。

初次尝试的玩家们可能会觉得这种新奇的游戏方式很有趣，虽然没有第一视角来得真实但是也能让玩家们认真投入游戏中，身体也会忍不住地跟着一起摆动起来，对于常年坐在电脑前工作的上班族来说或许是一个能运动颈椎的不错游戏。当然也会有玩家说这样晃动会头晕，如果不喜欢这样扭动脖子，游戏也提供了蓝牙手柄作为备选操作方案。

游戏有两个难度等级，进入飞行游戏画面后玩家可以通过收集各种颜色的光圈来增加分数，加距离，减速等等。游戏中，玩家可以自由穿梭在不断变化的游戏场景中，躲避各式各色的障碍物，游戏画面设计很简洁用简单的几何图形搭建起各个不同的场景。