既然您申请了证书，那么您可以试一下这样操作：

首先应确认您已经安装了支付宝的密码输入控件（相信您已经安装了）；

找到您申请的证书，这个，您应该保存在您的电脑上。直接双击它，然后根据它的提示来，一般直接点“下一步”就可以。另外中间有一个输入密码的界面，那个密码就是你的证书密码。

上面这个操作的目的是将证书导入到 IE 浏览器中。

如果上面的操作成功，OK，重新打开 IE ，登陆你的支付宝，这个时候，支付宝网站就会提示您：证书已经导入，但还需要进一步验证。您也只需要跟着它的提示来就可。

验证的方式有两种，一种是短信，一种是密码保护问题。选择适合您的方式进能验证即可。通过这次验证的话，就一切OK啦。。

希望以上能帮助您。